Thèse : MyGeneFriends : vers un nouveau rapport entre chercheurs et mégadonnées

Soutenance de thèse : Alexis ALLOT

Équipe : BFO

Titre : MyGeneFriends : vers un nouveau rapport entre chercheurs et mégadonnées

Résumé : Ces dernières années, la biologie a subi une profonde mutation, impulsée notamment par les technologies à haut débit et la montée de la génomique personnalisée. L’augmentation massive et constante de l’information biologique qui en résulte offre de nouvelles opportunités pour comprendre la fonction et l’évolution des gènes et génomes à différentes échelles et leurs rôles dans les maladies humaines. Ma thèse s’est articulée autour de la relation entre chercheurs et information biologique, et j’ai contribué à (OrthoInspector) ou créé (Parsec, MyGeneFriends) des systèmes permettant aux chercheurs d’accéder, analyser, visualiser, filtrer et annoter en temps réel l’énorme quantité de données disponibles à l’ère post génomique. MyGeneFriends est un premier pas dans une direction passionnante, faire en sorte que ce ne soient plus les chercheurs qui aillent vers l’information, mais que l’information pertinente aille vers les chercheurs sous une forme adaptée, permettant l’accès personnalisé et efficace aux grandes quantités d’informations, la visualisation de ces informations et leur interconnexion en réseaux.

Cette thèse a été dirigée par Odile Lecompte et co-encadrée par Olivier Poch. Cette dernière sera soutenue en français.

La présentation aura lieu le vendredi 9 octobre 2015 à 14h00 dans la salle 549 du bâtiment 3 de la Faculté de Médecine de Strasbourg.

Cette présentation sera précédée par un séminaire de Frédéric Chalmel qui aura lieu à 10h30 dans la même salle, sur le sujet "Integrative genomics and mammalian spermatogenesis"