Prix de la meilleure présentation aux JCI pour Nicolas Scalzitti (équipe CSTB)

Nicolas Scalzitti, doctorant dans l'équipe Systèmes Complexes, Bioinformatique Translationnelle (CSTB) au laboratoire ICube, a obtenu le prix de la meilleure présentation lors de l'édition 2021 des Journées du Campus d'Illkirch qui s'est déroulée le lundi 19 avril. Il a été récompensé pour sa communication orale intitulée : New strategies for genome annotation using deep learning algorithm.

Ce travail porte sur une nouvelle stratégie pour annoter les génomes effectuée à l'aide d'un algorithme de deep learning. Cette annotation des génomes implique l'identification des sites d'épissage (donneur et accepteur) des gènes codants pour des protéines chez les eucaryotes, cependant identifier ces sites reste encore un défi. Nous avons donc établi une nouvelle stratégie basée sur l'utilisation d'un algorithme de deep learning ainsi qu'un jeu de données multi-espèces de haute qualité spécialement conçue pour cette étude. Notre modèle, appelé Spliceator, obtient de très bonnes performances sur des jeux de référence indépendants et surpasse un des meilleurs prédicteurs de sites d'épissage.

Nous tenons à le féliciter pour ce prix.