Thèse : Conception assistée de lentilles de tube et développement instrumental en microscopie à plan oblique

La microscopie de fluorescence est couramment utilisée en biologie car elle permet d’imager en volumes avec contraste et spécificité. L’utilisation d’une illumination en feuille de lumière réduit la phototoxicité et le photoblanchiment, mais complexifie le montage des échantillons. Un de ses dérivés, la microscopie à plan oblique (OPM), permet de monter les échantillons de manière classique, sur lame ou via des plaques multi-puits. Dans le cadre de ce projet de recherche, l'intérêt a été porté à développer et améliorer cette technique.
Premièrement, les OPM nécessitent des lentilles de tube de focale précise, non disponibles dans le commerce. Un logiciel en source ouverte a été développé pour en générer en limitant les aberrations, à partir de deux lentilles achromatiques. Secondement, un OPM a été conçu et monté. Son immersion à huile réduit le coût tout en augmentant l’ouverture numérique, par rapport à une immersion à eau. Des acquisitions de C. elegans adultes et de larves de poissons zèbres ont été réalisées.