Thèse : Acquisition et reconstruction 3D de cultures pour l'estimation de surface de feuilles individuelles

Titre : Acquisition et reconstruction 3D de cultures pour l'estimation de surface de feuilles individuelles

Équipe : IGG

Résumé

Cette thèse s'intéresse au processus d'acquisition rapproché de données de phénotypage haut-débit des plantes dans les grande cultures et de mesures notamment de maïs. En effet les données de génotype des plantes sont maintenant bien connues et accessible. Cependant les données de phénotypages, qui sont l'expression du génotype dans un environnement donné, sont difficile à acquérir et aucune méthode standard optimale n'existe. Un protocole d'acquisition a été mis en place et exécuté afin de créer une première base de données avec des mesures de référence. Puis un modèle de génération de données synthétique de nuage de points de feuille a été proposé pour augmenter la taille et la variété de la base de données de tests. Enfin une méthode de reconstruction de surface a été proposé et comparé aux performances de méthodes de l'état de l'art pour l'obtention de l'aire de la surface foliaire. 

Les membres du Jury sont :

• Mme. DIGNE Julie : Rapporteur (CR, CNRS, LIRIS) 
• Mme. MORIN Géraldine : Rapporteur (Pr. INP Toulouse, IRIT)
• M. BARET Frédéric: Examinateur (DR INRAE, EMMAH)  
• M. GODIN Christophe : Examinateur (DR INRIA, RDP)   
• M.HETROY-WHEELER: Directeur de thèse (Pr. Université ICube Strasbourg)
• M.DE SOLAN Bénoît : Co-encadrant de thèse (IR, Arvalis)       
• M. JAY Sylvain : Invité (IR INRAE, EMMAH)