Martin Bücker (Université de Iena) fera une présentation vendredi 22 juin 2018, à 9h30 en A302, à Télécom physique Strasbourg (Illkirch).
Titre : Towards Reproducibility of Microscopy Experiments
Résumé : The rapid evolution of various technologies in different scientific disciplines has led to the generation of large volumes of high dimensional data. Studies have shown that most of the published work is not reproducible due to the non-availability of the datasets, code, algorithm, workflow, software, and technologies used for the underlying experiments. The lack of sufficient documentation and the deficit of data sharing among particular research communities have made it extremely difficult to reproduce scientific experiments. In this article, we propose a methodology enhancing the reproducibility of scientific experiments in the domain of microscopy techniques. Though our approach addresses the specific requirements of an interdisciplinary team of scientists from experimental biology to store, manage, and reproduce the workflow of their research experiments, it can also be extended to the requirements of other scientific communities. We present a proof of concept of a central storage system that is based on OMERO (Allan et al., Nature Methods 9, 245-253, 2012). We discuss the criteria and attributes needed for reproducibility of microscopy experiments.
Ce séminaire entre dans le cadre des séminaires de l'ED MSII.
Offers are available in the Job opportunities section of the ICube website or by clicking on the...
Le laboratoire ICube (Université de Strasbourg / CNRS / INSA / ENGEES ) et l'Institut de biologie...
Le travail d'EM3, valorisé au Japon et Corée du Sud. Le Pôle Véhicule du Futur, en collaboration...
Le programme RISE a été créé en 2019 par le CNRS pour accompagner les projets de start-up et les...
Cette année le 14 février, la Collectivité européenne d’Alsace, le Vaisseau et le Centre National...
Dr Lise Lecointre, gynécologue-obstétricienne aux Hôpitaux Universitaires de Strasbourg et...
D'ICube à la startup P-Layer P-Layer est un projet né d'une collaboration entre le laboratoire...
Le dernier numéro N° 47 de décembre de Savoir(s), le magazine d'information de l'Université de...
Le dernier numéro N° 47 de décembre de Savoir(s), le magazine d'information de l'Université de...
Le dernier numéro N° 47 de décembre de Savoir(s), le magazine d'information de l'Université de...
Le dernier numéro N° 47 de décembre de Savoir(s), le magazine d'information de l'Université de...