Thèse : Analyse multi-échelle de l’influence d’un sable de fonderie chimique sur les propriétés mécaniques de matériaux cimentaires

Soutenance de thèse : Paola PAUL

Titre : Analyse multi-échelle de l’influence d’un sable de fonderie chimique sur les propriétés mécaniques de matériaux cimentaires

Équipe : GCE

Résumé : Les projets de séquençage à haut débit produisent quotidiennement une énorme quantité de données biologiques brutes. Cependant, ces données sont difficilement exploitables si elles ne sont pas annotées. Afin de pouvoir traiter ces données massives, des programmes d’annotation de génomes ont été développés, malheureusement ces derniers sont encore trop sujets aux erreurs de prédiction, faisant de l’annotation des génomes un des défis majeurs en bio-informatique. Dans ce contexte, mes travaux de thèse s’organisent autour d’un trinôme indissociable : i) l’amélioration de la prédiction des gènes eucaryotes codant pour des protéines en se focalisant spécifiquement sur les sites d’épissage ii) en exploitant des algorithmes d’intelligence artificielle (réseaux de neurones convolutif et algorithmes évolutionnaires), iii) entraînés avec des données de haute qualité incluant une forte hétérogénéité d’organismes eucaryotes (de l’Homme aux protistes). La stratégie mise au point consiste à combiner l’ensemble des données traitées et validées (G3PO) avec les programmes développés (Spliceator et SpliceSLEIA) afin d’améliorer la prédiction des gènes en diminuant le taux d’erreurs afin qu’elles ne se propagent plus dans les bases de données publiques. De plus, ces travaux permettront une meilleure compréhension des organismes et de leurs mécanismes biologiques.

Les membres du Jury sont :

• Mme Françoise FEUGEAS : Professeure, INSA de Strasbourg, Directrice de thèse
• Mme Stéphanie BONNET  : Maître de conférences HDR, Université de Nantes, Rapporteure
• M. Boumediene NEDJAR  : Chargé de recherches HDR, Université Gustave Eiffel, Rapporteur
• M. Gilles ESCADEILLAS : Professeur, Université Toulouse III - Paul Sabatier, Examinateur
• M. Frédéric ANTONI    : Professeur, Université de Strasbourg, Examinateur
• Mme Cécile DILIBERTO  : Maître de conférences HDR, Université de Lorraine, Examinatrice

La soutenance se déroulera en français, le mercredi 29 Septembre 2021 à 10h30 dans l'amphithéâtre de Dietrich, à l'INSA de Strasbourg (24 boulevard de la Victoire 67084 Strasbourg).