Séminaire : Segmentation de métastases cérébrales par réseau de neurone convolutionnel

Odelin CHARRON de l'équipe MIV fera une présentation des travaux effectués lors de son stage, jeudi 24 août 2017, à 14h00 en C218, à Télécom physique Strasbourg (Illkirch).

Titre : Segmentation de métastases cérébrales par réseau de neurone convolutionnel

Résumé : La segmentation des métastases cérébrales est une étape essentielle lors de la planification avant traitement par radiothérapie. Effectué par le médecin en utilisant des images IRM du patient, celle-ci permet de localiser exactement la métastase cérébrale afin d'irradier uniquement la zone atteinte du cerveau, cependant cette segmentation est très médecin-dépendante, fastidieuse et prend du temps. Le but de mon projet est de mettre un point une pipeline permettant la segmentation automatique de ces métastases, l'approche retenue est celle des réseaux de neurones convolutionnel et notamment l'utilisation du réseau DeepMedic. La première partie de mon travail a été d'extraire les images du Centre Paul Strauss et de les pré-traiter afin de pouvoir les utiliser avec le réseau DeepMedic. Puis dans un second temps j'ai effectué un travail d'analyse des données étant en ma possession afin de déterminer quels paramètres essayer pour le réseau de neurone convolutionnel, trois approches ont finalement étés retenues : Le choix des modalités d'imagerie IRM, l'utilisation de patients "virtuels" et la
modification de certains paramètres globaux du réseau de neurones (nombre d'époques, taille de patchs...).