Martin Bücker (Université de Iena) fera une présentation vendredi 22 juin 2018, à 9h30 en A302, à Télécom physique Strasbourg (Illkirch).
Titre : Towards Reproducibility of Microscopy Experiments
Résumé : The rapid evolution of various technologies in different scientific disciplines has led to the generation of large volumes of high dimensional data. Studies have shown that most of the published work is not reproducible due to the non-availability of the datasets, code, algorithm, workflow, software, and technologies used for the underlying experiments. The lack of sufficient documentation and the deficit of data sharing among particular research communities have made it extremely difficult to reproduce scientific experiments. In this article, we propose a methodology enhancing the reproducibility of scientific experiments in the domain of microscopy techniques. Though our approach addresses the specific requirements of an interdisciplinary team of scientists from experimental biology to store, manage, and reproduce the workflow of their research experiments, it can also be extended to the requirements of other scientific communities. We present a proof of concept of a central storage system that is based on OMERO (Allan et al., Nature Methods 9, 245-253, 2012). We discuss the criteria and attributes needed for reproducibility of microscopy experiments.
Ce séminaire entre dans le cadre des séminaires de l'ED MSII.
Le dépôt des candidatures pour les postes d’enseignants-chercheur est ouvert. Les offres sont...
AFNOR Certification vient de renouveler la certification ISO 9001:2015 du Service de Cartographie...
La thématique de l'intelligence artificielle (IA) en lien avec la santé est forte au laboratoire...
Publiées au Journal officiel le vendredi 1er janvier 2021, les promotions de la Légion d'honneur et...
Le référentiel "ICube Software Collection" permet d'avoir une vue d'ensemble des logiciels...
Pour son édition 2020, la Journée des Jeunes Chercheurs en Robotique (JJCR2020) a eu lieu en ligne...
Le Challenge Mature Your PhD créé en 2019 par Conectus en partenariat avec les établissements de...
Un colloque consacré à la promotion de la science chez les femmes et à la diffusion des savoirs...
Reprise de l'article sur le site INSA Strasbourg du 24 novembre rédigé par Véronique...
L'extrait de l'article ci-dessous est tiré du dossier « Ces robots qui nous veulent du bien », à...
Dans le cadre du projet TC-Pro-UV (Traumatismes Crâniens et Protection des Usagers Vulnérables)...